Οι καταβολές των επιδοτήσεων αφορούν το βαμβάκι, τον αραβόσιτο, το σκληρό και μαλακό σιτάρι, το ρύζι, τη βιομηχανική τομάτα, τους καρπούς με κέλυφος και τους πρωτεϊνούχους σπόρους και θα γίνει μέσω του ΟΠΕΚΕΠΕ. Έτσι, εξασφαλίζεται ότι στις συγκεκριμένες ημερομηνίες που ανακοινώνονται θα υπάρχουν τα χρήματα στους τραπεζικούς λογαριασμούς των δικαιούχων παραγωγών.
Σημειώνεται ότι η οικονομική ενίσχυση των 350 εκ. ευρώ είναι ανεξάρτητη από το πακέτο των 500 εκ. ευρώ για τις αποζημιώσεις σε βασικά αγροτικά προϊόντα, του οποίου η εκταμίευση θα αρχίσει από το τρίτο δεκαήμερο του Μαρτίου.
Για το χρονοδιάγραμμα πληρωμών από τον Ο.Π.Ε.Κ.Ε.Π.Ε και τις περαιτέρω λεπτομέρειες του προγράμματος, ο Πρόεδρος του Ο.Π.Ε.Κ.Ε.Π.Ε. κ. Ξενοφών Βεργίνης δήλωσε τα εξής:
Οι προβλεπόμενες κοινοτικές επιδοτήσεις στους δικαιούχους αγρότες, αφορούν:  α) στις υπολειπόμενες ενισχύσεις στο πλαίσιο της Ενιαίας Ενίσχυσης, β) στις ειδικές ενισχύσεις συγκεκριμένων καλλιεργειών και γ) στις ενισχύσεις ποιοτικών παρακρατημάτων.
Συγκεκριμένα:
1. Στις 17 Μαρτίου 2009 θα πραγματοποιηθεί συμπληρωματική πληρωμή ενιαίας ενίσχυσης, ύψους 90 περίπου εκατομμυρίων ευρώ, για αριθμό 30.000 δικαιούχων αγροτών, οι οποίοι δεν πληρώθηκαν κατά τις πληρωμές που πραγματοποιήθηκαν το Δεκέμβριο 2008, λόγω λαθών και ελλείψεων στις αιτήσεις τους.
2. Μέχρι τις 10 Απριλίου 2009 (πριν το Πάσχα) θα πραγματοποιηθούν πληρωμές, στους δικαιούχους αγρότες, για τα ειδικά καθεστώτα.
Συγκεκριμένα, μέσα στο διάστημα:
- 18 – 20 Μαρτίου 2009 θα πληρωθούν οι ειδικές ενισχύσεις για το βαμβάκι (συνδεδεμένο 35%), τους πρωτεϊνούχους σπόρους και την πρόσθετη ενίσχυση αραβοσίτου. Σε 63.000 δικαιούχους με σύνολο κοινοτικού πλαφόν 192.289.525
- 26 – 27 Μαρτίου 2009, θα πληρωθούν οι πρόσθετες ενισχύσεις ποιοτικού παρακρατήματος (άρθρου 69) για το σκληρό σιτάρι, το μαλακό σιτάρι και η ειδική ενίσχυση σκληρού σιταριού. Σε 85.000 δικαιούχους με σύνολο κοινοτικού πλαφόν 44.956.850
- 1 – 3 Απριλίου 2009, θα πληρωθούν η ειδική ενίσχυση ρυζιού και η στρεμματική ενίσχυση για καρπούς με κέλυφος. Σε 21.000 δικαιούχους με σύνολο κοινοτικού πλαφόν 15.551.155 .
- 7 – 9 Απριλίου 2009, θα πληρωθούν οι ενισχύσεις στο ειδικό καθεστώς για τη βιομηχανική τομάτα. Σε 2500 δικαιούχους με σύνολο κοινοτικού πλαφόν 10.184.000.